Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RND3P61587 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RND3P61587 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RND3P61587 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RND3P61587 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RND3P61587 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RND3P61587 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RND3P61587 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RND3P61587 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RND3P61587 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RND3P61587 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RND3P61587 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RND3P61587 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RND3P61587 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RND3P61587 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RND3P61587 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RND3P61587 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RND3P61587 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RND3P61587 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RND3P61587 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RND3P61587 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RND3P61587 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RND3P61587 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RND3P61587 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RND3P61587 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RND3P61587 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND3P61587 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND3P61587 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND3P61587 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND3P61587 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RND3P61587 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND3P61587 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND3P61587 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND3P61587 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND3P61587 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RND3P61587 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RND3P61587 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RND3P61587 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RND3P61587 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RND3P61587 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RND3P61587 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RND3P61587 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RND3P61587 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RND3P61587 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RND3P61587 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RND3P61587 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RND3P61587 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RND3P61587 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RND3P61587 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RND3P61587 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RND3P61587 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RND3P61587 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RND3P61587 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RND3P61587 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RND3P61587 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RND3P61587 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RND3P61587 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RND3P61587 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RND3P61587 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RND3P61587 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RND3P61587 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RND3P61587 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RND3P61587 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RND3P61587 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RND3P61587 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RND3P61587 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RND3P61587 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RND3P61587 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RND3P61587 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RND3P61587 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RND3P61587 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RND3P61587 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RND3P61587 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RND3P61587 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RND3P61587 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RND3P61587 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RND3P61587 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RND3P61587 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RND3P61587 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RND3P61587 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RND3P61587 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RND3P61587 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RND3P61587 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RND3P61587 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RND3P61587 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RND3P61587 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RND3P61587 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RND3P61587 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RND3P61587 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RND3P61587 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RND3P61587 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND3P61587 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND3P61587 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms