Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX9P55771 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX9P55771 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX9P55771 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX9P55771 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX9P55771 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX9P55771 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PAX9P55771 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX9P55771 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAX9P55771 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAX9P55771 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX9P55771 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX9P55771 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAX9P55771 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX9P55771 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX9P55771 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX9P55771 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAX9P55771 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX9P55771 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX9P55771 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAX9P55771 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX9P55771 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAX9P55771 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAX9P55771 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX9P55771 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAX9P55771 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAX9P55771 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX9P55771 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX9P55771 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX9P55771 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAX9P55771 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAX9P55771 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAX9P55771 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAX9P55771 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX9P55771 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX9P55771 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX9P55771 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX9P55771 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX9P55771 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX9P55771 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX9P55771 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX9P55771 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX9P55771 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX9P55771 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX9P55771 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX9P55771 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX9P55771 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX9P55771 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAX9P55771 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX9P55771 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX9P55771 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PAX9P55771 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAX9P55771 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAX9P55771 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PAX9P55771 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX9P55771 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX9P55771 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX9P55771 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX9P55771 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX9P55771 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX9P55771 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX9P55771 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX9P55771 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX9P55771 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX9P55771 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX9P55771 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX9P55771 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX9P55771 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX9P55771 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX9P55771 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX9P55771 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX9P55771 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX9P55771 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX9P55771 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX9P55771 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX9P55771 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX9P55771 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX9P55771 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX9P55771 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX9P55771 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX9P55771 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX9P55771 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX9P55771 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX9P55771 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX9P55771 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX9P55771 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX9P55771 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX9P55771 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX9P55771 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX9P55771 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX9P55771 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PAX9P55771 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX9P55771 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX9P55771 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX9P55771 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX9P55771 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX9P55771 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX9P55771 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX9P55771 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX9P55771 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms