Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KNTC1P50748 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KNTC1P50748 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KNTC1P50748 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNTC1P50748 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KNTC1P50748 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KNTC1P50748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KNTC1P50748 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms