Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MRE11P49959 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MRE11P49959 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MRE11P49959 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MRE11P49959 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MRE11P49959 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MRE11P49959 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MRE11P49959 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MRE11P49959 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MRE11P49959 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MRE11P49959 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MRE11P49959 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MRE11P49959 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MRE11P49959 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
MRE11P49959 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
MRE11P49959 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MRE11P49959 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MRE11P49959 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MRE11P49959 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MRE11P49959 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MRE11P49959 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MRE11P49959 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MRE11P49959 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MRE11P49959 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MRE11P49959 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MRE11P49959 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MRE11P49959 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MRE11P49959 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MRE11P49959 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MRE11P49959 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MRE11P49959 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MRE11P49959 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MRE11P49959 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MRE11P49959 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MRE11P49959 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MRE11P49959 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MRE11P49959 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MRE11P49959 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MRE11P49959 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MRE11P49959 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MRE11P49959 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
MRE11P49959 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MRE11P49959 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MRE11P49959 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MRE11P49959 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MRE11P49959 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MRE11P49959 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MRE11P49959 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MRE11P49959 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MRE11P49959 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MRE11P49959 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MRE11P49959 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
MRE11P49959 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MRE11P49959 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MRE11P49959 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MRE11P49959 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MRE11P49959 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MRE11P49959 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MRE11P49959 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MRE11P49959 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MRE11P49959 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MRE11P49959 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MRE11P49959 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MRE11P49959 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MRE11P49959 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MRE11P49959 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MRE11P49959 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MRE11P49959 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MRE11P49959 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MRE11P49959 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
MRE11P49959 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MRE11P49959 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MRE11P49959 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MRE11P49959 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MRE11P49959 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MRE11P49959 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MRE11P49959 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MRE11P49959 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MRE11P49959 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MRE11P49959 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MRE11P49959 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MRE11P49959 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MRE11P49959 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MRE11P49959 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MRE11P49959 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MRE11P49959 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MRE11P49959 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MRE11P49959 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRE11P49959 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRE11P49959 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRE11P49959 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MRE11P49959 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MRE11P49959 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms