Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX2P48431 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX2P48431 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX2P48431 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX2P48431 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX2P48431 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX2P48431 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX2P48431 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX2P48431 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX2P48431 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX2P48431 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX2P48431 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX2P48431 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX2P48431 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX2P48431 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX2P48431 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX2P48431 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX2P48431 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX2P48431 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX2P48431 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX2P48431 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX2P48431 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX2P48431 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX2P48431 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX2P48431 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX2P48431 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX2P48431 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX2P48431 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX2P48431 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX2P48431 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX2P48431 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX2P48431 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX2P48431 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX2P48431 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX2P48431 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX2P48431 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX2P48431 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX2P48431 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX2P48431 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX2P48431 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX2P48431 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX2P48431 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX2P48431 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX2P48431 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX2P48431 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX2P48431 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX2P48431 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX2P48431 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX2P48431 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX2P48431 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX2P48431 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX2P48431 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX2P48431 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX2P48431 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX2P48431 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX2P48431 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX2P48431 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX2P48431 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX2P48431 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX2P48431 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX2P48431 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX2P48431 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX2P48431 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX2P48431 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX2P48431 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX2P48431 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX2P48431 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX2P48431 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOX2P48431 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX2P48431 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX2P48431 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX2P48431 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX2P48431 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX2P48431 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX2P48431 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX2P48431 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX2P48431 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX2P48431 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX2P48431 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX2P48431 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX2P48431 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX2P48431 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX2P48431 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX2P48431 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX2P48431 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX2P48431 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX2P48431 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX2P48431 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX2P48431 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX2P48431 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX2P48431 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX2P48431 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX2P48431 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX2P48431 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX2P48431 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX2P48431 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX2P48431 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOX2P48431 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOX2P48431 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOX2P48431 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms