Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATRXP46100 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRXP46100 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRXP46100 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRXP46100 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATRXP46100 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATRXP46100 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATRXP46100 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRXP46100 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATRXP46100 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRXP46100 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRXP46100 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRXP46100 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRXP46100 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATRXP46100 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATRXP46100 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRXP46100 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRXP46100 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRXP46100 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRXP46100 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRXP46100 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRXP46100 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRXP46100 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRXP46100 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRXP46100 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRXP46100 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRXP46100 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRXP46100 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATRXP46100 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRXP46100 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRXP46100 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRXP46100 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRXP46100 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATRXP46100 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATRXP46100 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRXP46100 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRXP46100 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRXP46100 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATRXP46100 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRXP46100 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATRXP46100 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRXP46100 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATRXP46100 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRXP46100 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRXP46100 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRXP46100 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRXP46100 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATRXP46100 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRXP46100 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRXP46100 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRXP46100 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATRXP46100 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATRXP46100 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATRXP46100 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRXP46100 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRXP46100 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATRXP46100 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRXP46100 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATRXP46100 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRXP46100 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRXP46100 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRXP46100 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRXP46100 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATRXP46100 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRXP46100 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRXP46100 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRXP46100 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRXP46100 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRXP46100 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRXP46100 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRXP46100 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATRXP46100 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRXP46100 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRXP46100 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRXP46100 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRXP46100 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRXP46100 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRXP46100 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRXP46100 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATRXP46100 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRXP46100 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATRXP46100 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRXP46100 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRXP46100 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRXP46100 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRXP46100 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRXP46100 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRXP46100 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATRXP46100 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms