Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX2-1P43699 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX2-1P43699 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKX2-1P43699 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-1P43699 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX2-1P43699 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-1P43699 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-1P43699 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-1P43699 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX2-1P43699 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-1P43699 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-1P43699 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX2-1P43699 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX2-1P43699 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NKX2-1P43699 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKX2-1P43699 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NKX2-1P43699 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKX2-1P43699 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKX2-1P43699 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKX2-1P43699 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX2-1P43699 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX2-1P43699 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms