Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTGER3P43115 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGER3P43115 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER3P43115 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTGER3P43115 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTGER3P43115 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTGER3P43115 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTGER3P43115 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms