Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LRPPRCP42704 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
LRPPRCP42704 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LRPPRCP42704 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LRPPRCP42704 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LRPPRCP42704 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRPPRCP42704 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRPPRCP42704 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRPPRCP42704 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRPPRCP42704 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
LRPPRCP42704 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
LRPPRCP42704 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRPPRCP42704 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRPPRCP42704 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms