Protein–RNA interactions for Protein: P37058

HSD17B3, Testosterone 17-beta-dehydrogenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B3P37058 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HSD17B3P37058 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HSD17B3P37058 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HSD17B3P37058 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSD17B3P37058 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HSD17B3P37058 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSD17B3P37058 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms