Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
USP6P35125 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
USP6P35125 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
USP6P35125 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
USP6P35125 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
USP6P35125 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
USP6P35125 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
USP6P35125 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
USP6P35125 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
USP6P35125 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
USP6P35125 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
USP6P35125 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
USP6P35125 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
USP6P35125 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
USP6P35125 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
USP6P35125 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
USP6P35125 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
USP6P35125 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
USP6P35125 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
USP6P35125 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
USP6P35125 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
USP6P35125 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
USP6P35125 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
USP6P35125 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
USP6P35125 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
USP6P35125 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
USP6P35125 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP6P35125 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP6P35125 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP6P35125 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
USP6P35125 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
USP6P35125 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
USP6P35125 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
USP6P35125 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
USP6P35125 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
USP6P35125 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
USP6P35125 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
USP6P35125 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
USP6P35125 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP6P35125 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
USP6P35125 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
USP6P35125 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
USP6P35125 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
USP6P35125 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
USP6P35125 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
USP6P35125 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
USP6P35125 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
USP6P35125 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
USP6P35125 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
USP6P35125 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
USP6P35125 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
USP6P35125 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
USP6P35125 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
USP6P35125 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
USP6P35125 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP6P35125 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP6P35125 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
USP6P35125 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP6P35125 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP6P35125 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP6P35125 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
USP6P35125 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
USP6P35125 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
USP6P35125 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
USP6P35125 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
USP6P35125 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
USP6P35125 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36■■■■□ 3.35
USP6P35125 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36■■■■□ 3.35
USP6P35125 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
USP6P35125 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
USP6P35125 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
USP6P35125 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
USP6P35125 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP6P35125 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP6P35125 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP6P35125 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
USP6P35125 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP6P35125 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP6P35125 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
USP6P35125 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
USP6P35125 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
USP6P35125 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
USP6P35125 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP6P35125 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP6P35125 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP6P35125 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
USP6P35125 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
USP6P35125 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
USP6P35125 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms