Protein–RNA interactions for Protein: P28799

GRN, Granulins, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRNP28799 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRNP28799 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GRNP28799 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRNP28799 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRNP28799 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRNP28799 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRNP28799 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRNP28799 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRNP28799 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRNP28799 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRNP28799 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRNP28799 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRNP28799 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRNP28799 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRNP28799 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRNP28799 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRNP28799 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRNP28799 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRNP28799 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRNP28799 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRNP28799 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRNP28799 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRNP28799 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRNP28799 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRNP28799 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRNP28799 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRNP28799 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRNP28799 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRNP28799 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRNP28799 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRNP28799 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRNP28799 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRNP28799 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRNP28799 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRNP28799 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRNP28799 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRNP28799 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRNP28799 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRNP28799 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRNP28799 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRNP28799 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRNP28799 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRNP28799 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRNP28799 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRNP28799 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRNP28799 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRNP28799 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GRNP28799 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRNP28799 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRNP28799 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRNP28799 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRNP28799 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRNP28799 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRNP28799 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRNP28799 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRNP28799 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRNP28799 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRNP28799 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRNP28799 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRNP28799 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRNP28799 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRNP28799 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRNP28799 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRNP28799 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRNP28799 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRNP28799 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRNP28799 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRNP28799 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRNP28799 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRNP28799 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRNP28799 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRNP28799 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRNP28799 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRNP28799 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRNP28799 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRNP28799 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRNP28799 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRNP28799 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRNP28799 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRNP28799 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRNP28799 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms