Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS4Y1P22090 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS4Y1P22090 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS4Y1P22090 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS4Y1P22090 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS4Y1P22090 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS4Y1P22090 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms