Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRMP19623 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRMP19623 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRMP19623 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRMP19623 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRMP19623 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMP19623 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMP19623 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMP19623 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRMP19623 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMP19623 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMP19623 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRMP19623 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMP19623 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMP19623 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRMP19623 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMP19623 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRMP19623 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMP19623 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMP19623 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMP19623 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMP19623 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRMP19623 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMP19623 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMP19623 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMP19623 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMP19623 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMP19623 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMP19623 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRMP19623 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMP19623 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRMP19623 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRMP19623 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRMP19623 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRMP19623 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMP19623 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMP19623 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMP19623 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMP19623 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRMP19623 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMP19623 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMP19623 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRMP19623 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMP19623 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMP19623 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMP19623 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMP19623 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRMP19623 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRMP19623 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRMP19623 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRMP19623 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRMP19623 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRMP19623 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRMP19623 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRMP19623 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRMP19623 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRMP19623 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRMP19623 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRMP19623 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRMP19623 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRMP19623 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRMP19623 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRMP19623 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRMP19623 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRMP19623 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRMP19623 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRMP19623 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRMP19623 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRMP19623 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRMP19623 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRMP19623 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRMP19623 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRMP19623 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRMP19623 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRMP19623 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRMP19623 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRMP19623 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRMP19623 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SRMP19623 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRMP19623 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRMP19623 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRMP19623 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRMP19623 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRMP19623 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRMP19623 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRMP19623 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRMP19623 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRMP19623 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRMP19623 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRMP19623 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRMP19623 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRMP19623 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRMP19623 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRMP19623 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRMP19623 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRMP19623 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRMP19623 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRMP19623 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRMP19623 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRMP19623 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms