Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF4P18848 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF4P18848 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATF4P18848 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF4P18848 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATF4P18848 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF4P18848 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATF4P18848 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATF4P18848 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF4P18848 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF4P18848 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATF4P18848 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF4P18848 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF4P18848 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF4P18848 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF4P18848 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATF4P18848 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF4P18848 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF4P18848 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF4P18848 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATF4P18848 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF4P18848 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATF4P18848 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATF4P18848 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF4P18848 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF4P18848 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATF4P18848 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF4P18848 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATF4P18848 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF4P18848 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF4P18848 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATF4P18848 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATF4P18848 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF4P18848 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF4P18848 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF4P18848 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF4P18848 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF4P18848 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF4P18848 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF4P18848 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF4P18848 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF4P18848 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF4P18848 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATF4P18848 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF4P18848 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF4P18848 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF4P18848 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF4P18848 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF4P18848 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF4P18848 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF4P18848 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF4P18848 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF4P18848 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATF4P18848 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATF4P18848 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF4P18848 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF4P18848 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATF4P18848 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF4P18848 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF4P18848 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF4P18848 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF4P18848 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATF4P18848 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATF4P18848 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF4P18848 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF4P18848 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF4P18848 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF4P18848 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF4P18848 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF4P18848 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATF4P18848 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF4P18848 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF4P18848 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF4P18848 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF4P18848 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF4P18848 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATF4P18848 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATF4P18848 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF4P18848 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATF4P18848 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF4P18848 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF4P18848 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF4P18848 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF4P18848 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF4P18848 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF4P18848 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF4P18848 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF4P18848 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF4P18848 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF4P18848 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF4P18848 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF4P18848 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF4P18848 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF4P18848 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF4P18848 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF4P18848 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF4P18848 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF4P18848 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF4P18848 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATF4P18848 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms