Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB3P14651 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXB3P14651 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXB3P14651 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXB3P14651 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXB3P14651 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXB3P14651 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms