Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM253P0C7T8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMEM253P0C7T8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM253P0C7T8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM253P0C7T8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM253P0C7T8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM253P0C7T8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM253P0C7T8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms