Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYNP07948 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LYNP07948 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYNP07948 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LYNP07948 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LYNP07948 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYNP07948 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LYNP07948 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LYNP07948 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYNP07948 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYNP07948 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LYNP07948 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYNP07948 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LYNP07948 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYNP07948 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LYNP07948 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYNP07948 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYNP07948 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LYNP07948 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYNP07948 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYNP07948 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYNP07948 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LYNP07948 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYNP07948 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYNP07948 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYNP07948 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYNP07948 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYNP07948 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYNP07948 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LYNP07948 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYNP07948 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYNP07948 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LYNP07948 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LYNP07948 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYNP07948 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYNP07948 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYNP07948 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LYNP07948 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYNP07948 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYNP07948 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYNP07948 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYNP07948 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYNP07948 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYNP07948 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LYNP07948 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LYNP07948 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYNP07948 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYNP07948 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYNP07948 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LYNP07948 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYNP07948 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYNP07948 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYNP07948 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYNP07948 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYNP07948 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYNP07948 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYNP07948 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYNP07948 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYNP07948 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYNP07948 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYNP07948 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYNP07948 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYNP07948 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LYNP07948 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYNP07948 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYNP07948 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LYNP07948 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYNP07948 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYNP07948 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYNP07948 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYNP07948 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LYNP07948 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYNP07948 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYNP07948 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LYNP07948 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LYNP07948 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYNP07948 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYNP07948 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYNP07948 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYNP07948 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LYNP07948 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYNP07948 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYNP07948 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LYNP07948 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYNP07948 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LYNP07948 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYNP07948 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYNP07948 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYNP07948 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYNP07948 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LYNP07948 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LYNP07948 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYNP07948 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LYNP07948 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYNP07948 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LYNP07948 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYNP07948 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LYNP07948 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYNP07948 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LYNP07948 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms