Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP1A1P05023 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP1A1P05023 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP1A1P05023 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP1A1P05023 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP1A1P05023 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP1A1P05023 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP1A1P05023 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A1P05023 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP1A1P05023 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP1A1P05023 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP1A1P05023 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP1A1P05023 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A1P05023 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A1P05023 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A1P05023 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP1A1P05023 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP1A1P05023 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms