Protein–RNA interactions for Protein: P02787

TF, Serotransferrin, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFP02787 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFP02787 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFP02787 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFP02787 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TFP02787 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFP02787 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFP02787 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TFP02787 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFP02787 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFP02787 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TFP02787 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TFP02787 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFP02787 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TFP02787 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFP02787 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFP02787 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TFP02787 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TFP02787 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFP02787 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFP02787 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFP02787 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFP02787 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFP02787 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFP02787 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFP02787 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFP02787 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFP02787 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFP02787 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFP02787 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFP02787 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFP02787 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFP02787 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFP02787 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFP02787 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFP02787 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFP02787 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFP02787 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFP02787 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFP02787 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFP02787 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFP02787 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFP02787 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TFP02787 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFP02787 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFP02787 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFP02787 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFP02787 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFP02787 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFP02787 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFP02787 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFP02787 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFP02787 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TFP02787 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFP02787 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TFP02787 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFP02787 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFP02787 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFP02787 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFP02787 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TFP02787 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFP02787 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFP02787 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFP02787 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFP02787 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFP02787 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFP02787 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFP02787 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFP02787 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFP02787 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFP02787 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFP02787 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFP02787 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TFP02787 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFP02787 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFP02787 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFP02787 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TFP02787 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFP02787 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFP02787 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFP02787 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TFP02787 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFP02787 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFP02787 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TFP02787 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFP02787 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFP02787 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFP02787 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFP02787 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFP02787 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TFP02787 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFP02787 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFP02787 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFP02787 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFP02787 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFP02787 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFP02787 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFP02787 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFP02787 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFP02787 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFP02787 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms