Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA17P01571 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNA17P01571 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA17P01571 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA17P01571 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA17P01571 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA17P01571 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA17P01571 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA17P01571 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA17P01571 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA17P01571 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA17P01571 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA17P01571 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA17P01571 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA17P01571 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA17P01571 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA17P01571 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA17P01571 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA17P01571 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA17P01571 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA17P01571 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA17P01571 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA17P01571 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA17P01571 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA17P01571 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA17P01571 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFNA17P01571 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IFNA17P01571 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFNA17P01571 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms