Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNAP29O95721 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNAP29O95721 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNAP29O95721 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP29O95721 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAP29O95721 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNAP29O95721 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP29O95721 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP29O95721 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNAP29O95721 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP29O95721 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP29O95721 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP29O95721 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNAP29O95721 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms