Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FARP2O94887 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FARP2O94887 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FARP2O94887 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FARP2O94887 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FARP2O94887 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FARP2O94887 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FARP2O94887 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FARP2O94887 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FARP2O94887 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FARP2O94887 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FARP2O94887 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FARP2O94887 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FARP2O94887 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FARP2O94887 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FARP2O94887 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FARP2O94887 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FARP2O94887 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FARP2O94887 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FARP2O94887 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FARP2O94887 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FARP2O94887 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FARP2O94887 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FARP2O94887 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FARP2O94887 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FARP2O94887 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FARP2O94887 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FARP2O94887 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FARP2O94887 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FARP2O94887 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FARP2O94887 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FARP2O94887 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FARP2O94887 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FARP2O94887 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FARP2O94887 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FARP2O94887 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FARP2O94887 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FARP2O94887 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FARP2O94887 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FARP2O94887 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FARP2O94887 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FARP2O94887 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FARP2O94887 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FARP2O94887 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FARP2O94887 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FARP2O94887 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FARP2O94887 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FARP2O94887 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FARP2O94887 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FARP2O94887 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FARP2O94887 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FARP2O94887 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FARP2O94887 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FARP2O94887 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FARP2O94887 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FARP2O94887 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FARP2O94887 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FARP2O94887 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FARP2O94887 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FARP2O94887 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FARP2O94887 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FARP2O94887 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FARP2O94887 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FARP2O94887 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FARP2O94887 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FARP2O94887 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FARP2O94887 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FARP2O94887 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FARP2O94887 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FARP2O94887 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FARP2O94887 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FARP2O94887 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FARP2O94887 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FARP2O94887 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FARP2O94887 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FARP2O94887 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FARP2O94887 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
FARP2O94887 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FARP2O94887 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms