Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC6AO75865 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC6AO75865 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC6AO75865 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC6AO75865 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC6AO75865 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms