Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL41O60662 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL41O60662 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL41O60662 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL41O60662 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL41O60662 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL41O60662 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL41O60662 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms