Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPLO60437 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPLO60437 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPLO60437 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PPLO60437 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PPLO60437 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PPLO60437 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PPLO60437 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPLO60437 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPLO60437 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPLO60437 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPLO60437 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PPLO60437 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PPLO60437 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PPLO60437 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PPLO60437 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PPLO60437 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PPLO60437 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PPLO60437 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PPLO60437 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PPLO60437 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPLO60437 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPLO60437 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPLO60437 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPLO60437 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPLO60437 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPLO60437 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPLO60437 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPLO60437 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPLO60437 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PPLO60437 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PPLO60437 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PPLO60437 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PPLO60437 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PPLO60437 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PPLO60437 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PPLO60437 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PPLO60437 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PPLO60437 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPLO60437 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PPLO60437 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PPLO60437 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PPLO60437 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPLO60437 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PPLO60437 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPLO60437 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PPLO60437 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PPLO60437 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
PPLO60437 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPLO60437 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PPLO60437 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PPLO60437 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PPLO60437 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PPLO60437 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPLO60437 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
PPLO60437 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PPLO60437 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPLO60437 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
PPLO60437 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPLO60437 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PPLO60437 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPLO60437 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPLO60437 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPLO60437 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PPLO60437 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPLO60437 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPLO60437 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPLO60437 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPLO60437 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PPLO60437 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PPLO60437 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PPLO60437 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPLO60437 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPLO60437 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPLO60437 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPLO60437 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPLO60437 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PPLO60437 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PPLO60437 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PPLO60437 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPLO60437 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPLO60437 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPLO60437 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPLO60437 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPLO60437 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPLO60437 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPLO60437 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPLO60437 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPLO60437 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPLO60437 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPLO60437 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms