Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LINC01565O15544 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC01565O15544 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LINC01565O15544 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC01565O15544 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC01565O15544 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC01565O15544 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC01565O15544 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms