Protein–RNA interactions for Protein: O15198

SMAD9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD9O15198 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD9O15198 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMAD9O15198 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAD9O15198 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMAD9O15198 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMAD9O15198 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMAD9O15198 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms