Protein–RNA interactions for Protein: O00194

RAB27B, Ras-related protein Rab-27B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27BO00194 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB27BO00194 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB27BO00194 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27BO00194 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB27BO00194 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27BO00194 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27BO00194 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms