Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
I3L3M4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
I3L3M4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
I3L3M4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
I3L3M4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
I3L3M4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
I3L3M4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
I3L3M4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
I3L3M4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
I3L3M4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
I3L3M4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
I3L3M4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
I3L3M4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
I3L3M4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
I3L3M4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
I3L3M4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
I3L3M4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
I3L3M4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
I3L3M4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
I3L3M4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
I3L3M4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
I3L3M4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
I3L3M4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
I3L3M4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
I3L3M4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
I3L3M4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
I3L3M4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
I3L3M4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
I3L3M4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
I3L3M4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
I3L3M4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
I3L3M4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
I3L3M4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
I3L3M4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
I3L3M4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
I3L3M4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
I3L3M4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
I3L3M4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
I3L3M4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
I3L3M4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
I3L3M4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
I3L3M4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
I3L3M4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
I3L3M4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
I3L3M4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
I3L3M4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
I3L3M4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
I3L3M4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
I3L3M4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
I3L3M4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
I3L3M4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
I3L3M4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
I3L3M4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
I3L3M4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
I3L3M4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
I3L3M4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
I3L3M4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
I3L3M4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
I3L3M4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
I3L3M4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
I3L3M4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
I3L3M4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
I3L3M4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
I3L3M4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
I3L3M4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
I3L3M4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
I3L3M4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
I3L3M4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
I3L3M4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
I3L3M4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
I3L3M4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
I3L3M4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
I3L3M4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
I3L3M4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
I3L3M4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
I3L3M4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
I3L3M4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
I3L3M4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
I3L3M4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
I3L3M4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
I3L3M4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
I3L3M4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
I3L3M4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
I3L3M4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
I3L3M4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
I3L3M4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
I3L3M4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
I3L3M4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
I3L3M4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
I3L3M4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
I3L3M4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
I3L3M4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms