Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPH6UMI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABARAPH6UMI1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPH6UMI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABARAPH6UMI1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABARAPH6UMI1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABARAPH6UMI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms