Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BHMG1C9JSJ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BHMG1C9JSJ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BHMG1C9JSJ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BHMG1C9JSJ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BHMG1C9JSJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BHMG1C9JSJ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BHMG1C9JSJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BHMG1C9JSJ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BHMG1C9JSJ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BHMG1C9JSJ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BHMG1C9JSJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms