Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERPINE3A8MV23 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINE3A8MV23 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINE3A8MV23 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINE3A8MV23 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SERPINE3A8MV23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINE3A8MV23 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms