Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C5orf51A6NDU8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C5orf51A6NDU8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf51A6NDU8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C5orf51A6NDU8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C5orf51A6NDU8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms