Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0U1RQS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
A0A0U1RQS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
A0A0U1RQS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
A0A0U1RQS6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
A0A0U1RQS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
A0A0U1RQS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
A0A0U1RQS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms