Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTP4A2Q12974 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTP4A2Q12974 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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