Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 YNL179CYNL179C 438 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 GDI1YER136W 1356 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 GIS1YDR096W 2685 nt2.18□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 MES1YGR264C 2256 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 MCD1YDL003W 1701 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 PRP6YBR055C 2700 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 USO1YDL058W 5373 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 TIF35YDR429C 825 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 RPL27BYDR471W 411 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YIR020CYIR020C 303 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 ARR2YPR200C 393 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 AFR1YDR085C 1863 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SMC6YLR383W 3345 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 RGA1YOR127W 3024 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 ALK2YBL009W 2031 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 KAR9YPL269W 1935 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 DAL5YJR152W 1632 nt2.17□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 TOR2YKL203C 7425 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 VPS16YPL045W 2397 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 RPS17BYDR447C 411 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 KOG1YHR186C 4674 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 YMR144WYMR144W 1029 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 RSA1YPL193W 1146 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SNF12YNR023W 1701 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 MSL5YLR116W 1431 nt2.16□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 SIR4YDR227W 4077 nt2.15□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 STH1YIL126W 4080 nt2.15□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 MGM1YOR211C 2646 nt2.15□□□□□ -2.06
LDB17Q12342 NOP14YDL148C 2433 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YCR108CYCR108C 192 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 PEA2YER149C 1263 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 GIC1YHR061C 945 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YJR141WYJR141W 1044 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YBL108WYBL108W 306 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 Q0017Q0017 162 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 IST2YBR086C 2841 nt2.15□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 SPP41YDR464W 4308 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 RRP12YPL012W 3687 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 snR84snR84 550 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 PRM8YGL053W 714 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 PRS3YHL011C 963 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YLR302CYLR302C 363 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 IGO1YNL157W 507 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 MIX23YBL107C 591 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 SFM1YOR021C 642 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 BRE1YDL074C 2103 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YJL070CYJL070C 2667 nt2.14□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 KAP123YER110C 3342 nt2.13□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YDL009CYDL009C 324 nt2.13□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 DGR1YNL130C-A 147 nt2.13□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YPL034WYPL034W 498 nt2.13□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 RPS26BYER131W 360 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 IST3YIR005W 447 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 ILM1YJR118C 612 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 LSM2YBL026W 288 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YBR071WYBR071W 636 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YBR197CYBR197C 654 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YBR277CYBR277C 402 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 TUS1YLR425W 3924 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 PES4YFR023W 1836 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 PHR1YOR386W 1698 nt2.12□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 RRI2YOL117W 1938 nt2.11□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 LRP1YHR081W 555 nt2.11□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YIL029CYIL029C 429 nt2.11□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 HHT2YNL031C 411 nt2.11□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YPR096CYPR096C 303 nt2.11□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 TAE2YPL009C 3117 nt2.11□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 COS111YBR203W 2775 nt2.11□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 SSF2YDR312W 1362 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 SEC16YPL085W 6588 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 SCH9YHR205W 2475 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 SNU56YDR240C 1479 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 BRP1YGL007W 378 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 DFG10YIL049W 762 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YLR202CYLR202C 327 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YOL150CYOL150C 312 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YOR364WYOR364W 369 nt2.1□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 UFD4YKL010C 4452 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 APQ13YJL075C 417 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 RPS22BYLR367W 393 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 VPS20YMR077C 666 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 VTI1YMR197C 654 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 MRPL44YMR225C 297 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 TRM7YBR061C 933 nt2.09□□□□□ -2.07
LDB17Q12342 RRP6YOR001W 2202 nt2.09□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.08□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YGL165CYGL165C 579 nt2.08□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.08□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 UBP2YOR124C 3819 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 CHZ1YER030W 462 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YGR290WYGR290W 444 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YLR252WYLR252W 306 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YHC1YLR298C 696 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 YLR379WYLR379W 375 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 MSS18YPR134W 807 nt2.07□□□□□ -2.08
LDB17Q12342 PSO2YMR137C 1986 nt2.07□□□□□ -2.08
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