Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms