Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC181Q5TID7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms