Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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EXT1Q16394 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXT1Q16394 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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