Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 NCB2YDR397C 441 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 SNO3YFL060C 669 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 RCN1YKL159C 636 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YML037CYML037C 1023 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 LSM2YBL026W 288 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 SNO2YNL334C 669 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YOL029CYOL029C 606 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 ARL3YPL051W 597 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 RSA1YPL193W 1146 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YCL007CYCL007C 393 nt2.37□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 snR9snR9 187 nt2.36□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.36□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 TMA20YER007C-A 546 nt2.36□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YJR023CYJR023C 402 nt2.36□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 ALG14YBR070C 714 nt2.36□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 MUD1YBR119W 897 nt2.36□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 RSE1YML049C 4086 nt2.36□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YJL181WYJL181W 1836 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 RRP12YPL012W 3687 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YFR056CYFR056C 369 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 RAD6YGL058W 519 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 DFG10YIL049W 762 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 HYR1YIR037W 492 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 CSE4YKL049C 690 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YKL066WYKL066W 444 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 HRI1YLR301W 735 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 VTI1YMR197C 654 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 CSM4YPL200W 471 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YPL150WYPL150W 2706 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 HAA1YPR008W 2085 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 AFI1YOR129C 2682 nt2.35□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YHR078WYHR078W 1659 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 RPL29YFR032C-A 180 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YGR228WYGR228W 345 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 PRP21YJL203W 843 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 SHE2YKL130C 741 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YMR254CYMR254C 309 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 YPL276WYPL276W 438 nt2.34□□□□□ -2.03
CIK1Q01649 REF2YDR195W 1602 nt2.34□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 NDD1YOR372C 1665 nt2.34□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 MCD1YDL003W 1701 nt2.34□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YIL058WYIL058W 285 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YJR087WYJR087W 351 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 RAM2YKL019W 951 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YOR055WYOR055W 435 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 ATX2YOR079C 942 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 RRP6YOR001W 2202 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 APM3YBR288C 1452 nt2.33□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YPP1YGR198W 2454 nt2.32□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 IRC8YJL051W 2469 nt2.32□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 BNI1YNL271C 5862 nt2.32□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 MSL5YLR116W 1431 nt2.32□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 GIP3YPL137C 3831 nt2.32□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 UBP11YKR098C 2154 nt2.32□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 CLN3YAL040C 1743 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 RRI2YOL117W 1938 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 snR70snR70 164 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YDR018CYDR018C 1191 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 RPL27BYDR471W 411 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 IST3YIR005W 447 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YLR379WYLR379W 375 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YLR458WYLR458W 381 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 SSF1YHR066W 1362 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 REV1YOR346W 2958 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 VPS64YDR200C 1815 nt2.31□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 STH1YIL126W 4080 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 PDR1YGL013C 3207 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 FMP16YDR070C 282 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 AAD16YFL057C 459 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YGR226CYGR226C 210 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 LAG1YHL003C 1236 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 AIM18YHR198C 966 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 AIM19YIL087C 474 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YOR152CYOR152C 771 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 TRS20YBR254C 528 nt2.3□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 PTC5YOR090C 1719 nt2.29□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 RPL40AYIL148W 387 nt2.29□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 PEP8YJL053W 1140 nt2.29□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YOR283WYOR283W 693 nt2.29□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 MGR1YCL044C 1254 nt2.29□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 NAN1YPL126W 2691 nt2.29□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.28□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.28□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 ARV1YLR242C 966 nt2.28□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 FKS3YMR306W 5358 nt2.28□□□□□ -2.04
CIK1Q01649 MET18YIL128W 3099 nt2.28□□□□□ -2.05
CIK1Q01649 DNF1YER166W 4716 nt2.27□□□□□ -2.05
CIK1Q01649 YJL070CYJL070C 2667 nt2.27□□□□□ -2.05
CIK1Q01649 VMA21YGR105W 234 nt2.27□□□□□ -2.05
CIK1Q01649 SCEIQ0160 708 nt2.27□□□□□ -2.05
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