Protein–RNA interactions for Protein: P41834

UFE1, Syntaxin UFE1, yeastyeast

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFE1P41834 YAP7YOL028C 738 nt2.13□□□□□ -2.07
UFE1P41834 DNF1YER166W 4716 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 SNX41YDR425W 1878 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 OCA6YDR067C 675 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 DAD4YDR320C-A 219 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 GMC2YLR445W 567 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 RRT16YNL105W 429 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YNL150WYNL150W 408 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 KAR9YPL269W 1935 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 AMS1YGL156W 3252 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 TOR2YKL203C 7425 nt2.12□□□□□ -2.07
UFE1P41834 SAP185YJL098W 3177 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 BRE1YDL074C 2103 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 TIM11YDR322C-A 291 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 EMC4YGL231C 573 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 VMA21YGR105W 234 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YJL086CYJL086C 369 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 ATP18YML081C-A 180 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YNL046WYNL046W 519 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.11□□□□□ -2.07
UFE1P41834 SLX9YGR081C 633 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 ARF3YOR094W 552 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YOR169CYOR169C 465 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YPR172WYPR172W 603 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 snR191snR191 274 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 GAL80YML051W 1308 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YKL075CYKL075C 1353 nt2.1□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YDR537CYDR537C 606 nt2.09□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YGR228WYGR228W 345 nt2.09□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YGR242WYGR242W 309 nt2.09□□□□□ -2.07
UFE1P41834 MRP49YKL167C 414 nt2.09□□□□□ -2.07
UFE1P41834 CSI1YMR025W 888 nt2.09□□□□□ -2.07
UFE1P41834 SIP18YMR175W 240 nt2.09□□□□□ -2.07
UFE1P41834 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.09□□□□□ -2.08
UFE1P41834 TRZ1YKR079C 2517 nt2.09□□□□□ -2.08
UFE1P41834 BFR1YOR198C 1413 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 SHE4YOR035C 2370 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 SCEIQ0160 708 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RRF1YHR038W 693 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 MIX23YBL107C 591 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 SFM1YOR021C 642 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RRG8YPR116W 834 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YRR1YOR162C 2433 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 SEN54YPL083C 1404 nt2.08□□□□□ -2.08
UFE1P41834 KAP123YER110C 3342 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YDL187CYDL187C 330 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 VPS74YDR372C 1038 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 CSE4YKL049C 690 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 SWS2YNL081C 432 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YNR021WYNR021W 1215 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 COQ10YOL008W 624 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 LOA1YPR139C 903 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 AFR1YDR085C 1863 nt2.07□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YDL016CYDL016C 303 nt2.06□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RTS3YGR161C 792 nt2.06□□□□□ -2.08
UFE1P41834 TAP42YMR028W 1101 nt2.06□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YMR144WYMR144W 1029 nt2.06□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.06□□□□□ -2.08
UFE1P41834 ISU1YPL135W 498 nt2.06□□□□□ -2.08
UFE1P41834 PEX8YGR077C 1770 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YPR097WYPR097W 3222 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 IRC2YDR112W 309 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RPL27BYDR471W 411 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YGL042CYGL042C 306 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 ERV1YGR029W 570 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RLP24YLR009W 600 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RCN2YOR220W 798 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 MEI5YPL121C 669 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 VID24YBR105C 1089 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RRI2YOL117W 1938 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 GCN2YDR283C 4980 nt2.05□□□□□ -2.08
UFE1P41834 CRD1YDL142C 852 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 STE18YJR086W 333 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 DAL5YJR152W 1632 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 NYV1YLR093C 762 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 UBX4YMR067C 1251 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YNL018CYNL018C 1839 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 SWM2YNR004W 441 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 PEP12YOR036W 867 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 Q0017Q0017 162 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 UFD4YKL010C 4452 nt2.04□□□□□ -2.08
UFE1P41834 SNF12YNR023W 1701 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 ROY1YMR258C 1662 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 AHC2YCR082W 387 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 TIF35YDR429C 825 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RPS26BYER131W 360 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 LRP1YHR081W 555 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YIL029CYIL029C 429 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 YNL179CYNL179C 438 nt2.03□□□□□ -2.08
UFE1P41834 RIO2YNL207W 1278 nt2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.3 ms