Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC5P28715 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC5P28715 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms