Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NDUFA12Q9UI09 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 665.4 ms