Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 SKM1YOL113W 1968 nt5.14□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YEL045CYEL045C 426 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YER053C-AYER053C-A 114 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 RPL37AYLR185W 267 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 CSR1YLR380W 1227 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 AIP1YMR092C 1848 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 MDM20YOL076W 2391 nt5.13□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 FRE1YLR214W 2061 nt5.12□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 CCT7YJL111W 1653 nt5.12□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 TUL1YKL034W 2277 nt5.12□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 RPS16BYDL083C 432 nt5.12□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 snR35snR35 204 nt5.12□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 KRI1YNL308C 1776 nt5.11□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 ELM1YKL048C 1923 nt5.11□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 AIM21YIR003W 2040 nt5.11□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YDR230WYDR230W 348 nt5.11□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 RPL28YGL103W 450 nt5.11□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YPR092WYPR092W 306 nt5.11□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 DNF2YDR093W 4839 nt5.11□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 STE20YHL007C 2820 nt5.1□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 GPR1YDL035C 2886 nt5.1□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 RIM15YFL033C 5313 nt5.1□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 AIM11YER093C-A 414 nt5.1□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 MDM32YOR147W 1869 nt5.1□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 SNC2YOR327C 348 nt5.1□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 SAR1YPL218W 573 nt5.1□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 KIP3YGL216W 2418 nt5.09□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 MIP6YHR015W 1980 nt5.09□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 NUP116YMR047C 3342 nt5.09□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.09□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.09□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.09□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 FRE4YNR060W 2160 nt5.09□□□□□ -1.59
NCR1Q12200 FPK1YNR047W 2682 nt5.09□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 PGM2YMR105C 1710 nt5.09□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 snR74snR74 88 nt5.08□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 RPS26BYER131W 360 nt5.08□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 APC4YDR118W 1959 nt5.07□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 SET3YKR029C 2256 nt5.07□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 FRS1YLR060W 1788 nt5.07□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YGL239CYGL239C 315 nt5.07□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 SRL3YKR091W 741 nt5.07□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 CCW14YLR390W-A 717 nt5.07□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YPL182CYPL182C 384 nt5.07□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 JHD2YJR119C 2187 nt5.06□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 GCN20YFR009W 2259 nt5.06□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 FKH2YNL068C 2589 nt5.06□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YFR035CYFR035C 345 nt5.06□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YSH1YLR277C 2340 nt5.05□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 NPC2YDL046W 522 nt5.05□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 DPB11YJL090C 2295 nt5.05□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YKL222CYKL222C 2118 nt5.05□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YMR196WYMR196W 3267 nt5.05□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YNL211CYNL211C 261 nt5.04□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 PSP1YDR505C 2526 nt5.04□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 GRC3YLL035W 1899 nt5.04□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 YEL1YBL060W 2064 nt5.04□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 SSB2YNL209W 1842 nt5.04□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 LCD1YDR499W 2244 nt5.04□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 CDC45YLR103C 1953 nt5.04□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 ACM1YPL267W 630 nt5.03□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 SUL2YLR092W 2682 nt5.03□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 IPT1YDR072C 1584 nt5.03□□□□□ -1.6
NCR1Q12200 VHC1YBR235W 3363 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 POL12YBL035C 2118 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YJR085CYJR085C 318 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YOR102WYOR102W 351 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 SPB1YCL054W 2526 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YGR125WYGR125W 3111 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YTA12YMR089C 2478 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 STB2YMR053C 2553 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 FAP1YNL023C 2898 nt5.02□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 KAR2YJL034W 2049 nt5.01□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YOL153CYOL153C 1746 nt5.01□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 CAF4YKR036C 1932 nt5.01□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 PEX6YNL329C 3093 nt5□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 HUL5YGL141W 2733 nt5□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 CLF1YLR117C 2064 nt5□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YER121WYER121W 345 nt5□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 TFC8YPL007C 1767 nt5□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 TUP1YCR084C 2142 nt5□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 ATH1YPR026W 3636 nt5□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 THI7YLR237W 1797 nt4.99□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt4.99□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 YJL206CYJL206C 2277 nt4.98□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 PCA1YBR295W 3651 nt4.98□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 GEP4YHR100C 558 nt4.97□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 GIS2YNL255C 462 nt4.97□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 ECM22YLR228C 2445 nt4.97□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 PAN3YKL025C 2040 nt4.97□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 PRP43YGL120C 2304 nt4.96□□□□□ -1.61
NCR1Q12200 MDR1YGR100W 2853 nt4.96□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 SEC39YLR440C 2130 nt4.96□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 DLS1YJL065C 504 nt4.96□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 CDC27YBL084C 2277 nt4.96□□□□□ -1.62
NCR1Q12200 URC2YDR520C 2319 nt4.96□□□□□ -1.62
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