Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 PAU1YJL223C 363 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 DGK1YOR311C 873 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 AME1YBR211C 975 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YBR277CYBR277C 402 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YPR097WYPR097W 3222 nt1.98□□□□□ -2.09
DDI1P40087 PRP38YGR075C 729 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 COX6YHR051W 447 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YAP5YIR018W 738 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 COX8YLR395C 237 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YBL108WYBL108W 306 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 TRM7YBR061C 933 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 YBR197CYBR197C 654 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 GIS1YDR096W 2685 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 RPN3YER021W 1572 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 MES1YGR264C 2256 nt1.97□□□□□ -2.09
DDI1P40087 THG1YGR024C 714 nt1.96□□□□□ -2.1
DDI1P40087 IGO1YNL157W 507 nt1.96□□□□□ -2.1
DDI1P40087 MIX23YBL107C 591 nt1.96□□□□□ -2.1
DDI1P40087 ARL1YBR164C 552 nt1.96□□□□□ -2.1
DDI1P40087 UTP22YGR090W 3714 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 COS111YBR203W 2775 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 NEO1YIL048W 3456 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YCR099CYCR099C 468 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 ASG7YJL170C 630 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SPR2YOR214C 711 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 ARR2YPR200C 393 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 PSO2YMR137C 1986 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 KAP123YER110C 3342 nt1.95□□□□□ -2.1
DDI1P40087 KOG1YHR186C 4674 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 GCN2YDR283C 4980 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 PES4YFR023W 1836 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 MSL5YLR116W 1431 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SHS1YDL225W 1656 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 RPS24AYER074W 408 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 VMA7YGR020C 357 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 AIM19YIL087C 474 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SMD3YLR147C 306 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YMR144WYMR144W 1029 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 VTI1YMR197C 654 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SRL4YPL033C 846 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SSE1YPL106C 2082 nt1.94□□□□□ -2.1
DDI1P40087 VTC3YPL019C 2508 nt1.93□□□□□ -2.1
DDI1P40087 PAI3YMR174C 207 nt1.93□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YOL106WYOL106W 354 nt1.93□□□□□ -2.1
DDI1P40087 PRK1YIL095W 2433 nt1.93□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SCP160YJL080C 3669 nt1.93□□□□□ -2.1
DDI1P40087 RRP6YOR001W 2202 nt1.93□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SEC31YDL195W 3822 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SNF12YNR023W 1701 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 ATG11YPR049C 3537 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 GCN4YEL009C 846 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 NTF2YER009W 378 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 STE2YFL026W 1296 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 VPS51YKR020W 495 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YLR379WYLR379W 375 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YBL012CYBL012C 402 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 GIM5YML094W 492 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 RPS16AYMR143W 432 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 END3YNL084C 1050 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YNR021WYNR021W 1215 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 DIS3YOL021C 3006 nt1.92□□□□□ -2.1
DDI1P40087 RPS26BYER131W 360 nt1.91□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YFR057WYFR057W 456 nt1.91□□□□□ -2.1
DDI1P40087 CAP1YKL007W 807 nt1.91□□□□□ -2.1
DDI1P40087 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt1.91□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SME1YOR159C 285 nt1.91□□□□□ -2.1
DDI1P40087 RXT2YBR095C 1293 nt1.91□□□□□ -2.1
DDI1P40087 AGC1YPR021C 2709 nt1.9□□□□□ -2.1
DDI1P40087 MPH1YIR002C 2982 nt1.9□□□□□ -2.1
DDI1P40087 SPC2YML055W 537 nt1.9□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SUS1YBR111W-A 291 nt1.9□□□□□ -2.11
DDI1P40087 REV3YPL167C 4515 nt1.9□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SAG1YJR004C 1953 nt1.9□□□□□ -2.11
DDI1P40087 ALK2YBL009W 2031 nt1.9□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YMR045CYMR045C 5268 nt1.89□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SFM1YOR021C 642 nt1.89□□□□□ -2.11
DDI1P40087 VID24YBR105C 1089 nt1.89□□□□□ -2.11
DDI1P40087 MUD1YBR119W 897 nt1.89□□□□□ -2.11
DDI1P40087 LRE1YCL051W 1752 nt1.89□□□□□ -2.11
DDI1P40087 ASG1YIL130W 2895 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 APL5YPL195W 2799 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 PUT3YKL015W 2940 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YDR199WYDR199W 366 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YGL165CYGL165C 579 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YLR224WYLR224W 1110 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 MSS18YPR134W 807 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 MED8YBR193C 672 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YNL034WYNL034W 1839 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 IST2YBR086C 2841 nt1.88□□□□□ -2.11
DDI1P40087 UBR2YLR024C 5619 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SSF1YHR066W 1362 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YDL157CYDL157C 357 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 RSM28YDR494W 1086 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 CWC23YGL128C 852 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 RSM27YGR215W 333 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 SWM2YNR004W 441 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YOL150CYOL150C 312 nt1.87□□□□□ -2.11
DDI1P40087 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.9 ms