Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP8A1Q9Y2Q0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP8A1Q9Y2Q0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms