Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SPRYD3Q8NCJ5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPRYD3Q8NCJ5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms