Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTP4A2Q12974 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTP4A2Q12974 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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