Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 STE2YFL026W 1296 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 YGR050CYGR050C 357 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 YGR053CYGR053C 852 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 PEX4YGR133W 552 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 PET191YJR034W 327 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 SPR2YOR214C 711 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 YOL098CYOL098C 3114 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 BNI1YNL271C 5862 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 FUS1YCL027W 1539 nt2.17□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 UBP15YMR304W 3693 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 TRZ1YKR079C 2517 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 ATP16YDL004W 483 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 SUI2YJR007W 915 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 YLL044WYLL044W 447 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 GIM5YML094W 492 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 TPS2YDR074W 2691 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 AMS1YGL156W 3252 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 BFR1YOR198C 1413 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 SPB1YCL054W 2526 nt2.16□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 TAE2YPL009C 3117 nt2.15□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 RLF2YPR018W 1821 nt2.15□□□□□ -2.06
RRP42Q12277 ADK1YDR226W 669 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 MPO1YGL010W 525 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 COG2YGR120C 789 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YJL202CYJL202C 348 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 RRT16YNL105W 429 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 PEX17YNL214W 600 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YNL226WYNL226W 411 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 ESF2YNR054C 951 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 UTP22YGR090W 3714 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 HRD3YLR207W 2502 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 COG3YER157W 2406 nt2.15□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YDR338CYDR338C 2088 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 CLN3YAL040C 1743 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 STH1YIL126W 4080 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 TFC3YAL001C 3483 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 EDS1YBR033W 2760 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 snR76snR76 109 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YFH1YDL120W 525 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 RSM28YDR494W 1086 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 COX3Q0275 810 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 VPH2YKL119C 648 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YOL134CYOL134C 390 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 INP51YIL002C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 PCK1YKR097W 1650 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 VPS38YLR360W 1320 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SNX41YDR425W 1878 nt2.14□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 NTF2YER009W 378 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 EST3YIL009C-A 546 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 AYR1YIL124W 894 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YET1YKL065C 621 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YLR366WYLR366W 306 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 COX8YLR395C 237 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SGT1YOR057W 1188 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SME1YOR159C 285 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 DGK1YOR311C 873 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YBR062CYBR062C 543 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 VMA9YCL005W-A 222 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 ALY1YKR021W 2748 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 DAL5YJR152W 1632 nt2.13□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 CTF13YMR094W 1437 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 INP53YOR109W 3324 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 GCN4YEL009C 846 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 THG1YGR024C 714 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 VPS51YKR020W 495 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 BRX1YOL077C 876 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YBL108WYBL108W 306 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SUS1YBR111W-A 291 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 UFD4YKL010C 4452 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SHS1YDL225W 1656 nt2.12□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SSE1YPL106C 2082 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SCY1YGL083W 2415 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YCR013CYCR013C 648 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 TIM9YEL020W-A 264 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 GLC7YER133W 939 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 LOC1YFR001W 615 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 RNP1YLL046C 750 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YLR217WYLR217W 324 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 TMA10YLR327C 261 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YAP7YOL028C 738 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 IPP1YBR011C 864 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YFR016CYFR016C 3702 nt2.11□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 SAP185YJL098W 3177 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 YEA4YEL004W 1029 nt2.1□□□□□ -2.07
RRP42Q12277 CKA1YIL035C 1119 nt2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87.6 ms